pemerintahan dari, untuk dan oleh mahasiswa. Dengan demikian maka pelaksanaan atau sistem kelembagaan di KM UII dilakukan oleh mahasiswa UII, dari mahasiswa UII untuk mahasiswa UII itu sendiri. Pelaksanaan sistem kelembagaan yang demikian itu mensyaratkan adanya dua aspek, yakni kemandirian dan independensi dalam berlembaga.

Kemandirian dimaknai sebagai sesuatu yang berdiri sendiri dan tidak bergantung kepada pihak manapun. Sementara independensi bermakna bebas dan merdeka. Dengan demikian, maka pemerintahan mahasiswa yang dikehendaki oleh KM UII adalah pemerintahan yang tidak bergantung, berdiri sendiri, bebas dan merdeka. Hal ini sejalan dengan spirit atau nilai juang yang melatar belakangi lahirnya student government, mahasiswa UII menempatkan lembaga mahasiswa sebagai “kawah candradimuka” untuk meningkatkan potensi dan kualitas diri, baik dalam kualitas spiritual, moral dan intelektual. Hal ini tidak lepas dari tujuan KM UII itu sendiri, yakni “Terbinanya mahasiswa UII menjadi Insan Ulil Albab yang turut bertanggungjawab atas terwujudnya tatanan masyarakat yang diridhoi Allah SWT”, oleh UII, Insan Ulil Albab diterjemahkan sebagai Cendekiawan Muslim dan Pemimpin Bangsa sebagaimana yang tertera dalam Visi UII.

Nilai-nilai yang termuat dalam student government (kemandirian dan independensi) dapat diwujudkan melalui lima hal:

• Dalam hal regenerasi fungsionaris lembaga, segala proses regenerasi dilaksanakan oleh mahasiswa secara mandiri dan independen, tanpa ada pengaruh dari pihak mahapun.
• Dalam hal kegiatan, seluruh proses perencanaan, pelaksanaan hingga pertanggungjawaban dilaksanakan secara mandiri oleh lembaga mahasiswa. Hal ini memungkinkan bagi lembaga mahasiswa untuk berkreasi dengan leluasa, tanpa intervensi, “pesanan”, dan tekanan dari pihak manapun.
• Dalam hal keuangan, seluruh proses penerimaan, pengelolaan dan pendistribusian hingga pertanggung jawaban dana kemahasiswaan juga dilaksanakan secara mandiri oleh lembaga mahasiswa.
• Organisasi KM UII tidak terikat secara struktural dengan UII, tidak berada dibawah Rektorat maupun Dekanat. Namun demikian, bukan berarti bahwa KM UII terpisah dengan UII, karena KM UII merupakan bagian dari UII yang tidak dapat dipisahkan. Hubungan antara KM UII dengan UII dijalankan secara koordinatif. Untuk itu dalam pelaksanaannya sangat mengedepankan hubungan yang sinergis dan harmonis antara lembaga mahasiswa dengan pihak UII, baik dalam lingkup universitas maupun fakultas.
• KM UII memiliki sikap politik yang bebas dan merdeka. Hal ini menegaskan bahwa dalam menentukan sikap politik, tidak ada pihak manapun yang dapat mengintervensi atau mempengaruhinya.